明四川總鎮巡撫：雒遵，得知消息後，急忙派遣明四川總鎮總兵：李應祥，率兵前去征討，以防叛軍擴大戰局騷擾軍民。
6月23日，明建州左衛軍民千戶：愛新覺羅·努爾哈赤，爲報復堂弟章佳氏四世祖：愛新覺羅·薩木佔，襲殺妹夫明建州左衛軍民百戶：噶哈善·哈思虎，之仇，特意率兵4百人前往馬爾墩寨征討。
其中；愛新覺羅·納木佔、愛新覺羅·薩木佔，兄弟倆就與族人：章佳·油申、章佳·完濟漢，一起對抗建州左衛軍民指揮使司軍隊苦戰四日，最終馬爾敦寨城破。
章佳·油申、章佳·完濟漢，兩人逃往建州右衛軍民指揮使司界凡城地界。
緊接着漠南蒙古內喀爾喀巴林部首領：孛兒只斤·把兔兒，爲報父汗：孛兒只斤·速把亥，之仇，與從父漠南蒙古內喀爾喀烏齊葉特部首領：孛兒只斤·舒哈克卓哩克圖鴻巴圖爾（炒花）、姑婿漠南蒙古翁牛特部首領：孛兒只斤·花大。
聯合了漠南蒙古內喀爾喀扎魯特部左翼首領：孛兒只斤·以兒鄧、葉赫女真部東城貝勒：納拉·納林布祿、葉赫女真部西城貝勒：納拉·布寨，以15萬鐵騎去掠奪大明遼東都指揮使司瀋陽中衛物資，又轉而攻打開原衛、鐵嶺衛，等地。
但很快就被明太子太保兼遼東總鎮總兵：李成樑，與明廣寧前屯衛兵備道左參議：李鬆，及時出兵給擊敗，還斬殺敵軍八百人。
7月10日，明都察院湖廣道監察御史：龔仲慶，再次疏劾明太僕寺少卿：李植，以及明詹事府右春坊右中允：吳中行、明太常寺少卿：沈思孝，三人爲邪臣。
8月初9日，明神宗：朱翊鈞，採用了明太子少保兼禮部尚書：徐學謨，的建議，選擇大峪山爲造其陵墓之地，即日開始動工興建。
然而明太僕寺少卿：李植，則以上奏稱“壽宮地有積石。”
但明內閣首輔：申時行，則主張支持明禮部尚書，反被明都察院右僉都御史兼光祿寺少卿：江東之、明尚寶寺少卿：羊可立，一起上奏稱“地宮吉利則不宜有石，有石則宜另擇它處。”
但是明禮部尚書：徐學謨，則以私意主其非議，明內閣首輔也一味地支持此舉。
兩人還上奏辯解道“當初陛下閱查此地時，太僕寺少卿李大人、光祿寺少卿江大人，可並沒有說此地有石，今已有兩年，忽創此議，很明顯是爲了藉此傾害大臣。”
使得明神宗當即下令責罵明太僕寺少卿、明光祿寺少卿、明尚寶寺少卿，三人當時傻傻站着，均無一言敢發，還被奪俸祿半年。
9月15日，明太僕寺少卿：李植，等人仍堅持大峪山壽宮有石，並建議皇帝陛下習葬法之人，爲其「有石」說作證明，疏送上而不予呈報。
此時本與李、江、羊，三人相結交的明文淵閣大學士：王錫爵，居然恥與三人爲伍，便反戈一擊，說明太僕寺少卿三人從治張閣老、馮公公，之獄以來，輒自動依附於明詹事府右春坊右庶子：趙用賢，等攖鱗折檻之黨，且日尋戈矛。
僅有朝中的明太子少保兼武英殿大學士：許國、明工部尚書：楊巍、明刑部左侍郎：舒化，等大臣爲正義派。
與另一派互相彈劾對方，以勸說皇帝陛下不要換地爲主，畢竟隨意更換地區，是要動用許多人力和物力的。
於是明都察院山東道監察御史：韓國楨、明工科給事中：陳輿郊、明戶部主事：王敬民，等官員一起上奏彈劾明太僕寺少卿：李植，三人。
使得明神宗：朱翊鈞，雷霆大怒！直接將明太僕寺少卿：李植，貶爲戶部員外郎、明光祿寺少卿：江東之，貶爲兵部員外郎、明尚寶寺少卿：羊可立，貶爲大理寺評事。
然而明神宗仍然擔心壽宮有石，便在9月21日，再次親臨大峪山，結果證明選擇大峪山吉利，此地無石。
回宮之後，進而將明戶部員外郎：李植，三人直接貶出京去，這引起了另一部分人的不滿，並用自己的行動爲他們鳴冤不平。
接着明詹事府右春坊右中允：吳中行，上疏請求離職被准許，而明詹事府左春坊左贊善：趙用賢、明太常寺少卿：沈思孝，也要求離職歸裡，但不得允准。
隨後明詹事府左春坊左贊善就以明太子少保兼武英殿大學士：許國，等大臣力毀明戶部員外郎：李植，三人爲由，上奏抗疏說“朋黨之說，是小人用以去君子，空人國也。”
語態甚是憤激，也是自明代萬曆一朝，黨論興起之初！
10月初9日，明鄭淑妃：鄭妙瑾，因懂得皇帝陛下心意，處處討人喜歡，因而被晉封爲明鄭德妃，又加上再次懷有身孕以及已經生過一子，既；明皇二子：朱常漵，不過夭折了，和皇二女明雲和公主：朱軒姝，更深得明神宗的寵愛。
而這明鄭德妃：鄭妙瑾，之所以能夠贏得明神宗的歡心，並不只是因爲她的美貌，更多的是由於她的聰明機警、通曉詩文等，她人少有的才華。
如果專恃色相與寵愛，絕不可能如此歷久不衰，別的妃嬪對皇帝陛下百依百順，但心靈深處卻保持着距離和警惕。
唯獨明鄭德妃卻是那樣的天真爛漫、無所顧忌。
她竟然敢於直接挑逗和諷刺皇帝陛下，同時又能夠聆聽皇帝陛下的傾訴，替他排憂解愁。
在名分上，她屬於姬妾，但在精神上，她已經不把自己看成姬妾了，而明神宗也真正感覺到了這種精神交流的力量，她不但不像別的妃嬪一樣跟皇帝說話時低首彎腰，反而公然抱住皇帝，摸他的腦袋。
這種行爲在當時看來，屬於（大不敬）之舉，也是除了她之外，無人敢做的，也正是因爲她表現的不同，明神宗纔會把她視爲知己更加寵愛。
11月12日，由於明臨安府兼元江軍民府左參將：劉綎，他不僅嚮明蠻莫安撫使：思順，索要金寶、牙錦，等物。
還放縱明元江軍民府把總：謝世祿、明臨安府右參將：夏世勤、明騰衝衛鎮撫使：陳其正，三人強暴明蠻莫安撫使的漂亮妻妹！
而他手下的明瀾滄衛把總：廖文耀、明騰衝衛副總兵：王化龍，在騰越州以剋扣兵餉爲由，開始起兵作亂，焚燒城中居民170餘家。
雖然明元江軍民府左參將急忙前往騰越州鎮壓，但早就不堪忍受的明蠻莫安撫使，卻趁機出逃緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝。
明雲南總鎮巡撫：劉世曾，連忙將蠻莫安撫使司叛變之事上奏朝廷，請求將劉綎革職。
沒想到朝廷當即就同意了他的建議，還打算以明廣南衛遊擊將軍：劉天俸，代替！
好在明內閣首輔：申時行，擔心明蠻莫安撫使外逃附緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝，可能會引發一系列的連鎖反應，才特地寄信給明雲南總鎮巡撫，信中提道“思順叛逆，雖不足以爲大患，然恐諸夷因而解體，三宣無外蔽，騰衝衛有內變，此不可不爲雖慮。”
果然，明蠻莫安撫使：思順，外逃的消息傳出去後，又爲雲南承宣布政使司邊地引來了新一輪戰爭。
這使得另一邊的，明緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝國主：南達勃因（漢名：莽應裡）非常高興，就認爲孟密宣撫使司、孟養長官使司，又有叛離大明帝國的兆頭？可以輕易被人佔領了？
雖然明軍之前打敗過緬軍，但是緬軍勢力並未徹底被剿滅，因此明臨安府兼元江軍民府左參將也清醒地認識到了，疆域雖已廓清，但莽酋然舊肆大，若不亟加剿滅，終爲禍根蔓延。
便上奏稱“應乘勝進討，俟蕩平之後，另圖改土設流，平定之餘，更宜築關建堡，設大將旗鼓，以控制要衝，立諸司衙門而相爲犄角，隨行屯田之策以足食，而財可使富，保障堅於來形；又練土著之丁以足兵，而力可使強，邊境幾無患，滇南之安，永保萬世無虞矣。”
但是此舉不被朝廷重視，因爲黨爭原因，不僅沒有給予支持，連奏摺也是留中不發！
明萬曆十四年公元1586年2月初3日，明內閣首輔：申時行，帶頭提出請立明皇長子：朱常洛，爲皇太子殿下，是爲大明帝國儲君，以尊祖宗、重江山社稷。
還提出昔日，大明英宗正統睿皇帝陛下二歲而立、大明孝宗弘治敬皇帝陛下六歲而立、大明武宗正德毅皇帝陛下一歲即立爲皇太子，如今皇長子：朱常洛，已年滿五歲，應當即刻立爲皇太子，以正名定份。
恰好2月22日，明鄭德妃：鄭妙瑾，又生下了一子，是爲明皇三子：朱常洵。
這令明神宗非常喜愛，決定日夜守護在身旁，還冊封明鄭德妃爲明鄭皇貴妃，故此才下詔說道“今皇長子年幼體弱，等二三年後再行冊立。”
這道聖旨直接惹得朝廷內外議論紛紛，羣臣們都懷疑皇帝陛下將要立明皇三子：朱常洵，爲皇太子？
帶着疑問由明戶科右給事中：姜應麟，上奏提出道“皇貴妃雖賢，但所生之子，是爲皇三子，而恭妃所生育乃是長子，應當先進封恭妃，其次才進封貴妃，如此則與禮法不違，於情不廢，陛下要正名定分，當從內閣大臣之請，早立皇長子爲皇太子。”
這份奏摺讓明神宗看了之後非常震怒，直接就將奏摺扔在地上，拍打案桌並提筆回覆道“鄭皇貴妃敬奉勤勞，應當特別加封，把姜愛卿貶爲廣昌縣典史。”
接着明吏部員外郎：沈璟、明刑部主事：孫如法，也一起上奏道“恭妃生育長子，然五年來，未聞行進封之典，而德妃一生子即有皇貴妃之封，這皇貴妃之子焉能比得了皇長子？何故恭妃不得於五年敬奉之後，如此做法天下不能不疑！”