葉赫女真部東城的外城以石壘牆，城內外多設立多重疊障，又以巨木爲柵，內城中以石木壘牆，在城中的山上，上鑿山四圍爲絕壁，山上構築八角樓，以作葉赫女真部東城貝勒居室和指揮場所。
退守城中的葉赫女真部東城軍隊與葉赫女真部西城軍隊，一起憑藉着城池堅決拒守，被明軍猛攻兩日，才攻破外城兩道木柵。
待明軍接近城牆進攻時，城上的東西兩城葉赫女真部軍隊們，就接連放滾木雷石而下，先登上雲梯或者呂公車的明軍皆被砸死，又以箭鏃射穿布面甲明軍，城牆可謂是堅不可拔。
無奈之中明遼東總鎮總兵：李成樑，只好下令停止攻城，運來城外各種遠程火炮轟城，直到城牆崩塌，明軍們才一撲而上攻擊葉赫女真部東西兩城士兵，雙方死者無算。
還斬殺葉赫女真部東城主帥：納拉·把當亥，以及葉赫女真部東西兩城士兵五百五十四人。
在明軍的巨炮轟擊下，城中的葉赫女真部兩城士兵們開始恐慌起來，城中皆哀嚎哭泣。
也讓哈達女真部貝勒：納拉·孟格布祿，高興不已！
明軍在攻破外城之後，又以呂公車和雲梯去內城牆下，將攻城的火炮對準了內城目標，在幾聲火器轟炸過後，才讓葉赫女真部東西兩城貝勒感到害怕起來，連忙出城嚮明遼東總鎮總兵乞降。
並表示願意歸還所搶掠的哈達女真部敕書，接受朝廷條件，按期向朝廷稱臣納貢。
於是明遼東總鎮總兵：李成樑，很爽快地接受了葉赫女真部東城貝勒和葉赫女真部西城貝勒的乞降，下令停止攻城，並且禁令明軍趁機侵掠葉赫女真部軍民。
明軍們開始班師撤軍。
4月初1日，葉赫女真部東城貝勒：納拉·納林布祿、葉赫女真西城貝勒：納拉·布寨，按照乞降時明遼東總鎮總兵的要求，放還了被自己囚禁以及私自擁立的哈達女真部酋長：納拉·康古魯。
不過也使得朝廷在對待葉赫女真部東城貝勒時，仍然放心不下來，故此在其乞降放還納拉·康古魯，之後朝廷就下諭道“往若效順，朝廷賞不薄，江上遠夷以貂皮、人蔘至，必籍若以通，若布帛、米鹽、農器仰給於我，耕稼圍獵，坐收木枲、鬆實、山澤之利，爲惠大矣，今貢事絕，江上夷首梗，皆怨若，我第傳檄諸部，斬二酋頭來，俾爲長，可無煩兵誅也，今貸若，若何以報！”
朝廷的恫嚇，使葉赫女真部東城貝勒往日的行徑有所收斂，不得不按照朝廷的旨意行事，與哈達女真部均分敕書，分守邊境互不侵犯。
7月21日戌時，南直隸蘇州府、松江府，等地東風怒卷，導致太湖水漲潮高達二丈，大風拔木僕屋，田禾皆被淹沒。
7月27日，又有大雨晝夜不絕，使得禾苗腐爛！廬舍漂沒，居民大飢，復又起大疫，迫使米價暴漲，鬥米白銀二錢、鬥麥白銀一錢。
時人啖糠屑，以豆餅作粥，繼而又以草根樹木爲食，饑民屍體甚多，餓殍填塞，街巷濠塹浮死遍野，舟船皆不能行，城內外積骸如山。
朝廷不得不下發南直隸各部衙門庫銀，用來賑災安民以定人心。
8月初2日，孟養長官使司因感謝天兵（明軍）救助德威，特意遣使入貢，但此時的明雲南提刑按察使：李材、明廣南衛指揮使：劉天俸，卻因斬獲首級數量不實而被逮下獄，雲南官員多爲其鳴不平。
明孟密宣撫使：思忠、明蠻莫安撫使：思順，又繼續私下叛投緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝。
由於這兩人已經徹底潛逃到緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝去了，故此朝廷就讓思忠的母親：罕烘，思順的母親：罕送，代替他們的兒子領關防印章。
兩人還帶領緬軍在9月初7日，北上入侵佔領了孟密宣撫使司，打算威逼莫蠻安撫使司。
9月10日，緬軍攻打孟密宣撫使司，這讓新任的明孟密宣撫使：罕烘，弱不能敵，只能率領次子：思禮、三子：思仁，內奔去孟廣城，導致孟密宣撫使司爲緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝佔據。
但是四子：思化、五子：思豪，則內奔蠻莫安撫使司，佔爭蠻莫安撫使司地盤以及官職，甚至還聚衆暴橫。
然而明蠻莫安撫使：罕送，因蠻莫安撫使司爲孟密宣撫使司所轄地區，又加上外有緬軍逼近，內有明孟密宣撫使司同知：思化、明孟密宣撫使司副使：思豪，兩人起兵鬧事，且孟密宣撫使司已經丟失，蠻莫安撫使司又無險可守！
只得放棄蠻莫安撫使司地界，倉皇內奔一路逃入明軍駐地騰越州騰衝衛境內，請求明廷官員發落。
明雲南總鎮巡撫：蕭彥，等官員們見狀，欲扶立明蠻莫安撫使：罕送，使其仍歸蠻莫安撫使司鎮守駐地。
但云南都司府以及朝廷得信後，卻認爲不可輕啓兵端，故此明雲南總鎮巡撫便密令明雲南撫夷同知：漆文昌，先前往蠻莫安撫使司處招撫明孟密宣撫使司同知：思化。
隨後明雲南撫夷同知單騎入思化營，宣諭朝廷恩威，明孟密宣撫使司同知雖然聽命接旨，但卻說“思順叛漢（明）歸緬，不當有蠻莫安撫使司，吾有助孟養長官使司殺緬賊之功，現無所歸，願寄食蠻莫安撫使司。”
此舉被明雲南撫夷同知答應了這一要求，但也更加刺激了已歸附緬甸軍民宣慰使司兼東籲王朝的思順，他爲了奪回蠻莫安撫使司領土，而多次引緬軍來攻。
9月13日，明建州左衛軍民鎮撫使：愛新覺羅·努爾哈赤，在統一了建州女真五部之後，就開始在關外向女真各部們頒佈國政，自稱〈淑勒貝勒〉還逼迫明建州左衛軍民指揮使：鬆塔，升任他爲（軍民衛指揮僉事）。
並按照之前萬曆十一年還未建功立業時，來到海西女真葉赫部的約定娶親。
因爲之前葉赫女真部東城貝勒：納拉·楊吉砮，慧眼識人將只有9歲的小女：納拉·孟古哲哲，許配給了愛新覺羅·努爾哈赤。
還答應他，等到小女成人禮（盤發）長到出嫁之年（14歲）時，一定把她送往建州女真左衛軍民指揮使司與其完婚。
而當時的愛新覺羅·努爾哈赤，是非常願意與葉赫女真部聯姻，以壯大自己勢力的。
但是他卻很納悶，因爲葉赫女真部東城貝勒的大女兒：納拉·孟桑，已經年滿15歲成年了，完全可以現在就出嫁，爲何他卻將年幼的小女兒許配給自己呢？
在問了這個問題後，岳父葉赫女真部東城貝勒非常真誠地回答道“女真語：大女兒雖然年紀適合，可是她資質和相貌都很平庸，而小女兒雖然才僅僅只有9歲，可是她天資聰穎，品德出衆，這才配得上試百戶您啊！”
這句話讓當時的明建州左衛軍民試百戶：愛新覺羅·努爾哈赤，聽後滿心歡喜，趕緊打道回府準備了豐厚的聘禮送來，並且耐心等待過些年來娶親，也算是葉赫女真部東城貝勒對他的考驗，看看這個女婿究竟有沒有本事？
到了現在時隔五年，已經年滿14歲的小女兒：納拉·孟古哲哲，在兄長葉赫女真部東城貝勒：納拉·納林布祿，的護送下，來到了建州左衛軍民指揮使司（衛指揮所）費阿拉城內。
此時的新郎明建州左衛軍民指揮僉事：愛新覺羅·努爾哈赤，也已經是個大名鼎鼎的人物了，他親自率衆出城相迎，殺牛宰羊大宴成婚。
就連明建州左衛軍民指揮使：鬆塔、明建州右衛軍民指揮使：來留住、明建州衛軍民指揮使：李以難，也要給他幾分面子，親自前來祝賀婚禮。
席間新娘：納拉·孟古哲哲，也顯露出了她的文華出衆。
新娘論相貌；她面如滿月、端莊嫵媚、風姿獨具，論修養；她氣度寬宏、不喜奉承、不懼惡言、且舉止莊重大方、口無惡言、耳無妄聽、始終如一，毫無過失。
因此兩人結爲夫婦，婚後兩小無猜。
9月20日，因明甘肅總鎮總兵：劉承嗣，約束太嚴，時常鞭打部下，餉銀又不按時供給，惹得部衆們遂反抗起事，持刀欲殺明甘肅總鎮巡撫：曹子澄，想以此來要挾陝西行都指揮使司都司府發放軍餉。
朝廷得知後，立刻罷免了明甘肅總鎮巡撫：曹子澄，和明甘肅總鎮總兵：劉承嗣，的官職，併發放去陝西行都指揮使司肅州衛（嘉峪關）邊疆。
10月初4日，明都察院右都御史兼河道總督：潘季馴，建議河防八事，上奏道“其一；久任部臣，說水性有順逆，河情有分合，地勢有險夷，只有久任才能熟悉情況。其二；責成長令，說理河如理家，今沿河州縣長猶家長，調集伕役，備辦物料，宜有專責，州府縣官亦有總理之責。其三；禁調官夫。其四；預定工科。其五；立法增築。其六；添設堤官。其七；加幫填土。其八；接築舊堤。”
這八條治理黃河、長江，決堤之道均被明神宗：朱翊鈞，批准錄取。
明萬曆十七年公元1589年3月初9日，因以往被升任授的官員，皆需要入朝覲見皇帝陛下，當面叩頭謝恩。
然而久不視朝的明神宗：朱翊鈞，卻再一次令內官傳旨道“奏對數多，不耐勞劇，不臨朝視政。”
並傳令免去在京升任授官們的面謝禮，此後明神宗視朝次數越來越少！但也並非不上朝。
3月16日，因雲南承宣布政使司永昌軍民府一帶，之前招募了川、楚、粵，三處亡命之徒爲兵，分立在騰衝衛、姚安中屯守禦千戶所兩營。
以明大理府副總兵：劉綎，統領騰衝衛軍營，明楚雄府副總兵：鄧子龍，統領姚安中屯守禦千戶所軍營。
由於結果兩營主帥持功驕傲不服對方，再加上管理範圍有衝突，導致兩營發生鬥毆事件，地方官員上報朝廷，明神宗又因二將皆有功而視之不見。