4月30日，明神宗：朱翊鈞，調集了遼東都指揮使司山海衛、鐵嶺衛、廣寧衛、開原衛、遼陽衛，大寧都指揮使司保定府、山西行都指揮使司大同府、萬全都指揮使司宣府鎮宣府三衛、陝西都指揮使司固原衛、延綏總鎮榆林衛、寧夏衛，浙江都指揮使司寧波衛、四川都指揮使司重慶衛、河南都指揮使司宣武衛，等地明軍精銳之師。
又加上聯絡的海西扈倫葉赫女真部東城貝勒：納拉·金臺吉、葉赫女真部西城貝勒：納拉·布楊古，的2萬5千人也在牽制後金兵，並上奏請求明神宗也參與到討伐後金的戰役中。
卻沒想到，此時負責討伐後金的明遼東總鎮經略兼兵部左侍郎：楊鎬，已經從北直隸順天府帝都紫禁城開拔入通州衛，他會見了李氏朝鮮弘文館校理：李埁，讓他向李氏朝鮮王國送去自己的諮文。
並表示已接到皇帝陛下鼓舞附屬國李氏朝鮮王國的旨意，還要求李氏朝鮮郡王光海大君：李琿，務必要出兵一萬以助明攻金。
雖然李氏朝鮮聖節使：樸鼎吉，在途中被明遼東總鎮經略：楊鎬，所阻止，但後來又一路李氏朝鮮聖節使兼陳奏使：尹暉，也來到了紫禁城內。
還得到了大明天皇帝陛下要求李氏朝鮮王國軍隊，需服從明遼東總鎮經略調遣的聖旨，因此李氏朝鮮郡王迴避出兵的最後希望，也就破滅了。
在楊總鎮經略的諮文被送到李氏朝鮮王國之後，李氏朝鮮郡王就已知道已無迴旋餘地。
隨即便調兵遣將，徵發三手軍（炮手、射手、殺手）1萬人，加上其他人員共計1萬5千5百餘人，以李氏朝鮮晉寧大君兼京畿右道巡檢使：姜弘立，爲「都元帥」李氏朝鮮北兵使：金景瑞，爲〈副元帥〉這對於李氏朝鮮王國而言，已是相當精銳的陣容了。
5月20日，勝利的後金軍繼續北上進攻撫順守禦千戶所至鐵嶺衛之間的；撫安堡、三岔兒堡、花包衝堡、會安堡，纔回師汗庭赫圖阿拉城。
因此明遼東總鎮經略就擔心下一個被建奴進攻的地區，應該是清河堡？故此書信下令邊關守軍嚴防死守。
7月20日，果不其然後金軍又因糧食短缺，而從鴉鶻關攻入長城內地，開始掠奪東州堡、馬根單堡、散羊峪堡，直逼清河堡而來。
由於上次的洗劫，使得東州堡和馬根單堡附近都沒啥物資，所以僅有散羊峪堡被後金軍洗劫一空，隨即又立刻揮兵南下直撲清河堡地區。
但戰鬥還未正式開始，明清河堡總兵：鄒儲賢，就把楊總鎮經略在戰術上的叮囑，給全部拋於腦後了，未在小路險道重點阻擊，更未在鴉鶻關三道上設伏，而是直接在清河堡城樓拒敵。
因此對於明軍來說地形優勢蕩然無存，畢竟這鴉鶻關可是清河堡的咽喉。
這也讓後金覆育英明天命汗：愛新覺羅·努爾哈赤，帶領萬餘人順利來到城下，並直接攻城。
致使明清河堡總兵：鄒儲賢、明清河堡遊擊將軍：張方旆、明清河堡守備：張雲程，率領6千4百人明軍全部上城樓防守，以（攻戎炮、青銅弗朗基炮）轟炸後金軍隊。
而後金軍異常勇猛，不畏生死，對於砍過來的刀，根本不做任何避讓，挨刀也要跨上城牆，明軍們則準備充分，火炮、箭矢、火器，如雨點般灑下，給後金軍帶來了極大損失。
而關鍵時刻後金覆育英明天命汗見久攻不下，就找來了明降將孫女婿～後金三等副將：李永芳，勸降守軍將領們，但被拒絕了。
其中明清河堡總兵還回複道“汝既已投降，那咱們之間也再無朋友義氣可言，如再多言，開弓放箭。”
無奈之下，後金覆育英明天命汗就總結了教訓，讓後金八旗軍們以木板護身，歷經八次衝鋒，才終於把牆角挖好。
最終迫使城牆垮塌，後金軍得以成功入城。
而明軍近戰不如後金八旗軍勇猛，因此在白刃戰時，清河堡內六千四百餘人明軍全部覆沒，無一人投降。
戰後駐紮在靉陽堡的明義州衛左參將：賀世賢，聽聞清河堡有變？他急忙率兵疾馳出塞，追擊搬運物資的後金軍，還攻破了後金軍大營一柵，擊殺了154人。
但是這樣的勝利，已經無關乎整個戰役的走向了，撫順守禦千戶所、清河堡，等地的失陷，致使了全遼震動，很大程度上提升了後金八旗軍將士的底氣，也讓大明帝國重新認識到後金軍的強大實力。
同時李氏朝鮮郡王光海大君：李琿，派遣的李氏朝鮮都元帥：姜弘立，已經帶領李氏朝鮮軍隊1萬5千人，北上過了平安東道寧邊大都護府，與明遼東總鎮經略：楊鎬，帶領北上的8萬明軍，以及葉赫女真部2萬5千人，總計合兵12萬。
由手持尚方寶劍的明遼東總鎮經略負責帶領，其（尚方寶劍可以斬殺總兵以下官員，戶部又加軍費200萬兩白銀）準備出戰收復失地。
但剛出山海衛就遇到了明清河堡千總：陳大道、明清河堡把總：高炫徇，二位逃跑的將領，在詢問了結果之後，當場就被楊總鎮經略給下令斬首，以示大明軍威。
很快其餘官員也陸續被詔用，包括詔；明薊遼總督兼兵部右侍郎：汪可受，先出關代替明遼東總鎮巡撫：李維翰，駐守遼東都指揮使司遼陽衛、明保定府巡撫：薛三才，負責駐守北直隸保定府易州茂山衛、明都察院陝西道監察御史：陳王庭，代替明遼東總鎮巡按：楊一桂。
最後又以明太常寺少卿兼都察院右僉都御史：周永春，代替「遼東總鎮巡撫」。
在以明右軍都督府右都督：李如柏，升任遼東總鎮總兵（實行以李家人打擊建奴）又徵明山海衛總兵：杜鬆，明左軍都督府左都督：劉綎、明陝西都指揮僉事兼陝西總鎮總兵：柴國柱、明開原衛總兵：馬林、明保定府總兵：王宣、明宣府左衛總兵：趙夢麟、明廣寧衛右營遊擊將軍：劉遇節、明義州衛遊擊將軍：王捷、明瀋陽中衛遊擊將軍：王文鼎、明定遼右衛遊擊將軍：陳倫、明宣府左衛遊擊將軍：龔念遂、明宣府左衛都司：王浩、明宣府左衛左參將：張大紀、明宣府右衛都司：楊欽、明宣府右衛遊擊將軍：汪海龍、明宣府右衛左參將：楊汝達、明三萬衛遊擊將軍：李希泌、明開原衛副總兵：麻巖、明開原衛守備：江萬春、明開原衛兵備道僉事：潘宗顏、明開原衛兵備道參議：董爾礪、明開原衛兵備道副使：韓原善、明開原衛遊擊將軍：竇永澄、明開原衛千總：陳玉、明開原衛把總：王學雄、明海州衛遊擊將軍：丁碧、明鐵嶺衛遊擊將軍：鄭國良、明宣府前衛遊擊將軍：葛世鳳、明遼海衛遊擊將軍：趙啓楨、明宣府前衛左參將：李應選、明寬奠堡遊擊將軍：祖天定、明南直隸陸營都司：姚國輔、明山東即墨營都司：周文、明宣府前衛副總兵：江萬化、明靉陽堡守備：徐九思、明臨山衛鎮撫使：周翼明、明海蓋兵備道副使：康應乾、明海州衛指揮同知：黃宗周、明鎮江堡都司：喬一琦、明開原衛百戶：馬燃、明三萬衛千總：馬熠、明遼海衛守備：黃璦、明遼海衛把總：常因泰、明安樂州把總：何印、明威遠堡把總：王琯、明慶雲堡把總：陳一元、明慶雲堡中軍遊擊將軍：李維楨、明懿路守禦千戶所千總：刁國瑞、明懿路守禦千戶所把總：康世泰、蒲河守禦千戶所中軍遊擊將軍：董引。
明武功中衛監軍太監：熊惟英、明武功中衛千戶：李漸茂、明保定前衛試百戶：王納薦、明寧山衛遊擊將軍：郭之翰、明紹興衛指揮僉事：劉興周、明大同左衛鎮撫使：伊湯聘、明懷來衛副千戶：管鳴宮、明萬全左衛總旗：康民望、明鎮朔衛小旗：丁繼盛、明金州衛守備：劉吉龍、明神電衛指揮同知：劉招孫、明靖海守禦千戶：孫六。
明蓋州衛副總兵：於化龍、明蓋州衛左參將：高貞、明鐵嶺衛鎮撫使：喻成名、明鐵嶺衛千戶：史鳳鳴、明鐵嶺衛百戶：李克泰、明萬全右衛遊擊將軍：於守志、明遼海衛千總：任國忠、明東寧衛千總：張昌胤、明威寧營遊擊將軍：吳貢卿、明廣寧衛總兵：李光榮、明廣寧前屯衛副總兵：竇承武、明廣寧中屯衛都司：王紹勳、明通遠堡千總：張天祚、明重慶衛總旗：顏天佑、明赤水衛百戶：王弘化、明永寧衛把總：雷應龍、明威遠衛小旗：丘起鳳、明寧番軍民指揮使司中軍遊擊將軍：趙廷蘭、明玉林衛千總：麻進忠、明黎州軍民千總：魏相。
明德州衛把總：姚守冠、明寧川衛指揮同知：曹文烈、明寧番衛都司：趙奎、明建昌衛遊擊將軍：劉友才、明禹州守禦千戶：於景柱、明陳州衛試百戶：楊朝武、明信陽衛千總：代運旺、明武靖營守備：馬熬、明奉集堡守備：朱邦孝、明遼陽衛千總：楊一科、明覆州衛千總：李鶴、明定遼前衛把總：江應聘、明定遼中衛把總：陳國王、明定遼右衛把總：齊和、明廣寧左屯衛中軍遊擊將軍：胡邦奇、明撫寧衛千總：閻有功、明開平衛千總：鄭國忠、明通州右衛千總：高良玉、明薊州衛把總：趙鎮、明平越衛把總：李之中、明歸德衛總旗：朱萬與、明密雲後衛千戶：陸進忠、明鎮遠衛中軍遊擊將軍：周大盛、明赤水衛千總：程廉。
明振武衛小旗：王仲賢、明廣昌守禦副千戶：冷載裳、明高山衛鎮撫使：麻實、明延安衛把總：打代、明平涼衛把總：趙仲舉、明寧夏中衛把總：腮介哈監代、明綏德衛把總：李尚仁、明敘南衛指揮僉事：曹秉忠、明普市守禦千戶：萬人英、明潼關衛右參將：胡國弼。